As principais contra-indicações são:

• Cirurgias de ressecção gástrica prévia.
• Dependentes de álcool e drogas.
• Uso de anticoagulantes. 
• Gestantes
• Cirróticos descompensados, presença de varizes esofagogástricas.
• Doença do refluxo gastro-esofágico intenso , esofagite severa.
• Esôfago de Barrett (causado por refluxo gastro-esofágico). 
• Cirurgia de hernia de hiato prévia.

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